Fehérpataky Balázs pályáját gimnáziumi tanárként kezdte. Történelem és angol tanárként, oktatáskutató és fejlesztő szakemberként pedagógiai és módszertani fejlesztéssel foglalkozott. Később gimnázium igazgatóként meghatározó tapasztalatokat szerzett a közoktatás működéséről és fejlesztési lehetőségeiről. 2011-től az Oktatáskutató és Fejlesztő intézet munkatársaként, iskolai konfliktuskezeléssel foglalkozott több projekt szakmai vezetőjeként, és a gyakorlatban mediátorként számos oktatási vitarendezést vezetett le. Később az iskolai bántalmazás, a bullying jelenség vizsgálata felé fordult, nevéhez fűződik a nemzetközi KIVA anti-bullying program hazai adaptációjának elkészítése és bevezetése Magyarországon. 2020-től a Nemzeti Tehetség Központ munkatársaként a "Tehetségek Magyarországa" uniós projekt szakmai vezetője, 2022-től pedig a Mathias Corvinus Collegium egész Kárpát-Medencére kiterjedő Fiatal Tehetség Programjának vezetője. Emellett a Pázmány Péter Tudományegyetemen közoktatási vezetőknek tart személyiségfejlesztő és konfliktuskezelési készségeket fejlesztő tréningeket.